生物化學分析的準確性，除取決于分析方法的選擇是否合適以及全部分析工作是否嚴格按照要求進行外，在很大程度上還取決于樣品的采取是否有最佳的代表性。如果不遵循科學方法采樣，樣品缺乏代表性，即使分析工作嚴謹無誤，也得不到正確的結論。因此，必須對樣品的采取、處理和保存給予足夠的重視。
從大田或實驗田采回的樣品，一般數量較大，稱為“原始樣品”。再按原始樣品的種類(如根、莖、葉、花、果實等)分別選出“平均樣品”。再根據分析任務的要求和樣品的特征，從平均樣品中選出供分析用的“分析樣品”。由此可見，分析樣品的獲得須經一系列復雜而仔細的步驟，在實際工作中一定要以高度認真負責的態度對待。
(一)原始樣品及平均樣品的采取、處理與保存
原始樣品及平均樣品的采取，按分析目的可有兩種方法：一種是為了鑒定品質而進行的混合取樣;另一種是按植物生育期取樣。
1.混合取樣法：一般種子樣品可用混合取樣法。把代表一定面積的收獲物先經脫粒，然后在木板或牛皮紙上鋪成均勻的一層，再按對角線把樣品分成4 個三角形，取兩個相對的三角形的樣品，而將另外兩個三角形的樣品淘汰。如此操作，一直淘汰至所要求的數量為止。這個取樣法叫做“四分法”，這樣取得的平均樣品在實驗室經適當處理即可制成分析樣品。
豆類及油料種子選取平均樣品的方法與谷類種子取樣法相同。注意，樣品中不要有未成熟的種子或混雜物，不要將簸出去的種子加到平均樣品中。
如果直接從田里采取植株樣品，在生長均一的情況下，可按對角線或沿平行的直線等距離采樣。如果植株長勢不均勻，則應根據生長的強弱，按比例采取大約5 個點的樣品后混合。每個樣點取的植株數隨植物的種類和采樣的時間有所不同。如小麥等密植型作物或其它作物幼苗，可按面積采取或采取樣品束(一束樣品的植株數視需要而定)，象玉米、甘蔗等作物，每個樣點采取一株就夠了。
選取甘薯、馬鈴薯、甜菜、蘿卜等塊根、塊莖的平均樣品時，必須注意到大、中、小三類樣品的比例。然后縱切取其一部分(二分之一至四分之一)組織作為平均樣品，否則就不具有代表性。
一般蔬菜樣品也按對角線法采取。番茄樣品應選擇簇位相同、成熟程度一致的果實，取果實的1/4 組成平均樣品。
采取蘋果、梨、桃、柑橘等水果的平均樣品時，一般選1～3 株果樹為代表，從植株的全部收獲物中選取大、中、小果實以及向陽、背陽部分的果實混合成平均樣品。葡萄等漿果，采樣時可在不同地點的5～10 株植物上的各個部位包括向陽、背陽以及上、下各部位采樣。
2.按生育期取樣法：在幼苗期取樣，因植株較小，采取的株數就比較多，盡管各種作物有所不同，總的原則是所取樣品的干重應當是分析用的2 倍。
植株逐漸長大，每次采取的株數也相應減少，但絕不能采單株作樣品。在各個生育期取樣時，都應作觀察記錄。
取樣地點一般在邊行區，取樣點的四周不應有缺株現象。
取樣后，按分析目的分成各個部分，如根、莖、葉、穗等，然后捆好，附上標簽，分別裝入樣品袋。
瓜果、蔬菜取回后因水分較多，容易霉爛，可在冰箱中冷藏，或用于干燥滅菌，或用酒精處理或烘干，以供分析之用。
(二)分析樣品的處理與保存
采回的新鮮植株樣品如果混有泥土，不應用水沖洗，可用濕布擦凈，然后根據實驗目的進行凍存或烘干處理。
凍存樣品
凍存樣品時，先將樣品置于凍存管內或用錫箔紙包好，用筆做好標記，然后置于液氮中（-196℃）冷凍不低于30min，最后放置于超低溫冰箱（-80℃）中保存。
烘干樣品
烘干樣品時，可把植株放入80℃烘箱中，以停止酶活動并驅除水分。烘干樣品時，注意溫度不能過高，以免把植株烤焦。最好不要曬，以免灰塵沾染或被風刮走。
全植株樣品應按照根、莖、葉、種子等分開。果實必須剖出時，要用鋒利的不銹鋼刀子，不允許將其中汁液流失。
為了避免糖、蛋白質、維生素等成分的損失，可采用真空干燥或冷凍真空干燥法。風干或烘干的樣品，根據其特點分別進行以下處理：
1.種子樣品的處理：一般谷物種子的平均樣品可用電動樣品粉碎機粉碎。事先要把機器內收拾干凈，最初粉碎出的少量樣品可棄去不用，然后正式粉碎，使全部樣品通過一定篩孔的篩子，混合均勻，按四分法取出一定數量的樣品細粉作為分析樣品，貯存于干燥的磨口廣口瓶中，同時貼上標簽，注明樣品的名稱、編號、采取地點、處理、采樣日期和采樣人姓名等。長期保存時，標簽應涂石蠟，并在樣品中加適當的防腐劑。
蓖麻、芝麻等油料種子應取少量樣品在研缽內研碎，以免脂類損失。
2.莖稈樣品的處理：干燥后的莖稈樣品也要磨碎。粉碎莖稈的粉碎機不同于種子粉碎機，其切割部分由幾付排列方向相反的刀片組成。粉碎后的樣品按上法保存。
3.多汁樣品的處理：一般多汁樣品，如瓜果蔬菜等，其化學成分(糖、蛋白質、維生素等)在保存中易發生變化，往往多用新鮮樣品進行各項測定。將它們的平均樣品切成小塊，放入電動組織搗碎機中打成勻漿，如果樣品含水量較少，可按樣品重量加入適量水，然后搗碎。樣品量少時可用手持勻漿器或在研缽內研磨，必要時可在研缽內加少量石英砂。
如果所測物質不穩定(如某些維生素和酶等)，則上述操作均應在低溫下進行。樣品勻漿如來不及測定，可暫存冰箱內，或滅菌后密封保存。
4.丙酮干粉的制備：在分離、提純或測定某種酶的活力時，丙酮干粉法是常用的有效方法之一。
該種方法是將新鮮材料打成勻漿，放入布氏漏斗，按勻漿重量緩慢加入10倍的低溫冰箱內冷卻到-15℃～-20℃的丙酮，迅速抽氣過濾，再用5 倍冷丙酮洗3 次，在室溫下放置1 小時左右至無丙酮氣味，然后移到盛有五氧化二磷的真空干燥器內干燥。丙酮干粉的制備在低溫下完成，所提丙酮干粉可長期保存于低溫冰箱。用這種方法能有效地抽提出細胞中的物質，還能除掉脂類物質，免除脂類干擾，而且使得某些原先難溶的酶變得溶解于水。
